Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEFLP07196 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NEFLP07196 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFLP07196 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFLP07196 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFLP07196 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFLP07196 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEFLP07196 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFLP07196 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFLP07196 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFLP07196 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFLP07196 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFLP07196 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFLP07196 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFLP07196 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFLP07196 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEFLP07196 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFLP07196 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFLP07196 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFLP07196 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEFLP07196 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NEFLP07196 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFLP07196 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFLP07196 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFLP07196 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEFLP07196 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFLP07196 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFLP07196 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFLP07196 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFLP07196 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFLP07196 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFLP07196 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEFLP07196 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEFLP07196 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFLP07196 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFLP07196 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFLP07196 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFLP07196 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFLP07196 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFLP07196 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFLP07196 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEFLP07196 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFLP07196 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFLP07196 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFLP07196 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFLP07196 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFLP07196 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFLP07196 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFLP07196 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEFLP07196 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEFLP07196 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEFLP07196 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEFLP07196 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEFLP07196 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEFLP07196 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEFLP07196 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NEFLP07196 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEFLP07196 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEFLP07196 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NEFLP07196 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEFLP07196 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEFLP07196 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NEFLP07196 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFLP07196 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFLP07196 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFLP07196 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFLP07196 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEFLP07196 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFLP07196 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFLP07196 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFLP07196 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NEFLP07196 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFLP07196 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFLP07196 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFLP07196 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFLP07196 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEFLP07196 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFLP07196 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFLP07196 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEFLP07196 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEFLP07196 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEFLP07196 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFLP07196 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFLP07196 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFLP07196 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFLP07196 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFLP07196 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFLP07196 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEFLP07196 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEFLP07196 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms