Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK4O96013 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK4O96013 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK4O96013 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK4O96013 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK4O96013 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK4O96013 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK4O96013 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK4O96013 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK4O96013 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK4O96013 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK4O96013 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK4O96013 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK4O96013 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK4O96013 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK4O96013 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK4O96013 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK4O96013 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK4O96013 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK4O96013 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK4O96013 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK4O96013 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK4O96013 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK4O96013 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK4O96013 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK4O96013 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK4O96013 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK4O96013 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK4O96013 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK4O96013 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK4O96013 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK4O96013 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAK4O96013 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PAK4O96013 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAK4O96013 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAK4O96013 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAK4O96013 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAK4O96013 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PAK4O96013 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAK4O96013 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAK4O96013 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAK4O96013 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAK4O96013 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAK4O96013 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK4O96013 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK4O96013 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK4O96013 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK4O96013 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK4O96013 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK4O96013 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK4O96013 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK4O96013 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK4O96013 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK4O96013 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK4O96013 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms