Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNDBP1O95273 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNDBP1O95273 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNDBP1O95273 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1O95273 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1O95273 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms