Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIG2O94898 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG2O94898 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG2O94898 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms