Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR2O75167 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHACTR2O75167 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHACTR2O75167 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms