Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB11FIP3O75154 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP3O75154 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB11FIP3O75154 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms