Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUTAO60888 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUTAO60888 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CUTAO60888 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUTAO60888 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUTAO60888 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUTAO60888 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CUTAO60888 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUTAO60888 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUTAO60888 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUTAO60888 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUTAO60888 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUTAO60888 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUTAO60888 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUTAO60888 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUTAO60888 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUTAO60888 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUTAO60888 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUTAO60888 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUTAO60888 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUTAO60888 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUTAO60888 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUTAO60888 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUTAO60888 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CUTAO60888 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUTAO60888 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUTAO60888 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUTAO60888 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUTAO60888 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CUTAO60888 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUTAO60888 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUTAO60888 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUTAO60888 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUTAO60888 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUTAO60888 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUTAO60888 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUTAO60888 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUTAO60888 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUTAO60888 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUTAO60888 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUTAO60888 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUTAO60888 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUTAO60888 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUTAO60888 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUTAO60888 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUTAO60888 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUTAO60888 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUTAO60888 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUTAO60888 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUTAO60888 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUTAO60888 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUTAO60888 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CUTAO60888 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUTAO60888 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUTAO60888 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUTAO60888 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUTAO60888 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUTAO60888 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUTAO60888 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUTAO60888 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CUTAO60888 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUTAO60888 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CUTAO60888 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUTAO60888 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUTAO60888 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUTAO60888 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUTAO60888 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUTAO60888 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUTAO60888 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUTAO60888 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUTAO60888 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUTAO60888 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUTAO60888 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUTAO60888 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUTAO60888 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUTAO60888 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUTAO60888 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUTAO60888 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUTAO60888 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUTAO60888 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUTAO60888 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CUTAO60888 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CUTAO60888 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUTAO60888 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUTAO60888 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUTAO60888 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUTAO60888 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUTAO60888 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUTAO60888 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUTAO60888 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms