Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF2O60811 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF2O60811 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF2O60811 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms