Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GFRA3O60609 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GFRA3O60609 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GFRA3O60609 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms