Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD21O60216 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD21O60216 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD21O60216 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD21O60216 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD21O60216 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD21O60216 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD21O60216 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD21O60216 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD21O60216 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD21O60216 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD21O60216 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD21O60216 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD21O60216 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD21O60216 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD21O60216 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD21O60216 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD21O60216 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD21O60216 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD21O60216 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD21O60216 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD21O60216 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD21O60216 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD21O60216 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD21O60216 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD21O60216 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAD21O60216 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAD21O60216 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD21O60216 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD21O60216 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD21O60216 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD21O60216 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD21O60216 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD21O60216 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD21O60216 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD21O60216 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD21O60216 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD21O60216 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD21O60216 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD21O60216 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD21O60216 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD21O60216 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD21O60216 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD21O60216 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD21O60216 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD21O60216 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD21O60216 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD21O60216 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD21O60216 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD21O60216 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD21O60216 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD21O60216 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD21O60216 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD21O60216 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD21O60216 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD21O60216 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD21O60216 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD21O60216 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD21O60216 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD21O60216 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAD21O60216 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RAD21O60216 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAD21O60216 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD21O60216 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD21O60216 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD21O60216 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RAD21O60216 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD21O60216 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAD21O60216 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAD21O60216 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD21O60216 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAD21O60216 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RAD21O60216 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAD21O60216 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAD21O60216 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms