Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HTATSF1O43719 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
HTATSF1O43719 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms