Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPAA1O43292 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPAA1O43292 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPAA1O43292 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms