Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASKO14936 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASKO14936 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASKO14936 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASKO14936 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASKO14936 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASKO14936 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASKO14936 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASKO14936 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASKO14936 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASKO14936 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASKO14936 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASKO14936 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASKO14936 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASKO14936 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASKO14936 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASKO14936 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASKO14936 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASKO14936 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASKO14936 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASKO14936 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASKO14936 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASKO14936 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CASKO14936 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASKO14936 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASKO14936 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASKO14936 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASKO14936 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASKO14936 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASKO14936 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASKO14936 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASKO14936 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASKO14936 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASKO14936 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASKO14936 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASKO14936 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASKO14936 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASKO14936 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASKO14936 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASKO14936 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASKO14936 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASKO14936 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASKO14936 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASKO14936 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASKO14936 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASKO14936 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASKO14936 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASKO14936 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASKO14936 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASKO14936 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASKO14936 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASKO14936 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASKO14936 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASKO14936 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASKO14936 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASKO14936 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASKO14936 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASKO14936 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASKO14936 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASKO14936 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASKO14936 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASKO14936 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms