Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DYNC1I1O14576 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DYNC1I1O14576 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DYNC1I1O14576 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DYNC1I1O14576 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms