Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBAG9O00559 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBAG9O00559 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBAG9O00559 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms