Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GOLIM4O00461 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLIM4O00461 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLIM4O00461 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms