Protein–RNA interactions for Protein: O00299

CLIC1, Chloride intracellular channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC1O00299 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLIC1O00299 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIC1O00299 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIC1O00299 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms