Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8SH3BPF8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8SH3BPF8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms