Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD8-MDP1E9PL57 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-MDP1E9PL57 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms