Protein–RNA interactions for Protein: C9JLR9

C11orf95, Uncharacterized protein C11orf95, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf95C9JLR9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
C11orf95C9JLR9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
C11orf95C9JLR9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
C11orf95C9JLR9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms