Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNOT1A5YKK6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CNOT1A5YKK6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms