Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A1W2PPC1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A1W2PPC1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2PPC1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms