Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms