Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms