Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX7Q9UNH6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms