Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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