Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms