Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIPA1L2Q9P2F8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIPA1L2Q9P2F8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms