Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COMMD8Q9NX08 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms