Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRT82Q9NSB4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms