Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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