Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARFGAP3Q9NP61 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms