Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLMPQ9H6B4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms