Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2J2Q9GZM3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms