Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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