Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAPERQ9BY12 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms