Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK19Q9BWU1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms