Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIRIP3Q9BW71 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms