Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms