Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms