Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLDN23Q96B33 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLDN23Q96B33 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CLDN23Q96B33 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLDN23Q96B33 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN23Q96B33 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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