Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EME1Q96AY2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms