Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCAMP4Q969E2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms