Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC9Q92623 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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