Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms