Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMB4Q86W47 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms