Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms