Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF7Q6Q0C0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF7Q6Q0C0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms