Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZCCHC12Q6PEW1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZCCHC12Q6PEW1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms