Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms